
Små RNA (small RNA) är korta molekyler med 21-28 nukleotider. De förekommer i eukaryotiska celler vid sidan om RNA med funktioner som miRNA, siRNA, tnRNA och uppfyller viktiga funktioner vid regleringen av cellulära processer som t.ex. tillväxtreglering, differentiering, apoptos, cancerutveckling och neurogenes. Trots samma härstamning och funktion har de ofta andra beteckningar och delas in i olika klasser, t.ex. miRNA, (mikroRNA), siRNA (short interfering RNA), tnRNA (tiny non-coding RNA).
Chromatin immunoprecipitation (ChIP) är en in vivo-metod för att identifiera proteinernas bindningsställen i en DNA-sekvens. Det är viktigt med kunskap om sådana DNA-proteininteraktioner för att förstå många biologiska processer och diverse sjukdomstillstånd. Medan den etablerade ChIP-analysmetoden med mikromatriser är inskränkt till ett bestämt antal prov, tillåter en sekvensering med ”next generations” teknologier en karaktärisering av DNA-proteininteraktioner i ett helt genom i en enda omgång.
(D) +49 (0) 7531 81 60 68
(F) +33 (0) 4 91 82 84 88
(GB) +44 (0) 207 691 4921
(S) +46 (0) 8 655 3609
Genomics & Transcriptomes
Analyses & Visualisation
On the path to a deep understanding of the organism, two parameters are important to the interpretation of the Next Gen sequencing data: The use of various Next Gen systems to take advantage of each technology and the combination of different bioinformatic tools and their stepwise application.