GATC Biotech AG

GATC daughter LifeCodexx successfully completes clinical validation of its noninvasive prenatal test method of trisomy 21

Fri, 27 Apr 2012 13:22:00 +0200

GATC daughter LifeCodexx AG today announced the successful completion of the clinical validation study of its noninvasive test method for the detection of fetal trisomy 21 from maternal blood using Next Generation sequencing. First results from the prospective blinded multi-center study demonstrate highest clinical accuracy for the planned commercial PraenaTest® test design based on Cell-Free DNA™ blood collection tubes (BCT), detecting all positive cases of fetal trisomy 21 (100% sensitivity) with no false positive calls (100% specificity).

During the study, five prenatal centers and university hospitals in Germany and Switzerland recruited a total of 522 maternal blood samples from pregnant women with high risk of chromosomal alterations in the unborn child. Gestational age ranged from week 11+0 to 32+1. The main goal of the study was to compare detection rates for trisomy 21 of a test method based on Next Generation sequencing using maternal blood with conventional karyotyping using invasive methods, e.g. amniocentesis or chorionic villus sampling. For the study, maternal blood was sampled in two different ways, either using regular K3 EDTA blood collection tubes or Cell-Free DNA™ blood collection tubes (BCT). While for the K3 EDTA blood collection tubes the study centers had to prepare blood plasma at their sites before shipment, the use of Cell-Free DNA™ BCT required direct dispatch to LifeCodexx without any prior preparation work at the physician´s site.

First-cut analysis of the full set of recruited samples with 42 positive trisomy 21 cases showed an overall clinical sensitivity of 95% and specificity of 99.5%. However, a more detailed analysis revealed substantial differences between the blood sampling methods with regard to clinical sensitivity and specificity. The results of the blood samples which were stabilised in K3 EDTA blood collection tubes achieved a sensitivity rate of 81.8% and a specificity rate of 98.7% only. In contrast, blood sampling using Cell-Free DNA™ BCT yielded far better results with 100% clinical sensitivity and specificity. Cell-Free DNA™ blood collection tubes preserve cell-free DNA circulating in plasma, allowing sample collection and shipment at room temperature without any additional preparation work at the phycisians’ site.

“These clinical results demonstrate clearly the importance of a reliable and easy sampling procedure which is mandatory for an accurate noninvasive testing method based on Next Generation Sequencing ,” comments Dr. Wera Hofmann, Medical Director of LifeCodexx AG. “The results also validate our unique cost efficient 12-plex massively parallel sequencing method using Illumina HiSeq 2000 as well as our proprietary bioinformatic analysis technology. As a result, we are able to reliably quantify a possible overabundance of chromosome 21 relative to the amount of the other chromosomes.”

“The results of the study are very encouraging, because they clearly show that the test allows a very reliable noninvasive diagnosis for trisomy 21 in high-risk pregnancies,” comments PD Dr. Markus Stumm from the Berlin Center for Prenatal Diagnosis and Human Genetics. “The new test has the long-term potential to considerably reduce the number of procedure-related pregnancy losses induced by invasive diagnostic methods. It is a very interesting second-tier test, especially for women with an increased aneuploidy risk after first trimester screening.”

“We are currently in the final stage of preparing the regulatory dossier for CE approval so that PraenaTest® will be soon launched as an In Vitro Diagnostic (IVD) product. We expect that the test will be available initially within Germany, Switzerland, Austria and Liechtenstein,” says Dr. Michael Lutz, CEO of LifeCodexx.

LifeCodexx will present first results of the clinical study at a number of congresses over the coming weeks, e.g. at the „Tuebinger Praenataltage“ end of April 2012, the congress of the DGPGM in Bonn in May, the European Society of Human Genetics (ESHG) in Nuernberg as well as the BGGF in Wuerzburg in June.

About PraenaTest®

Based on the use of Next Generation Sequencing technology, the noninvasive prenatal diagnostic PraenaTest® is able to reliably exclude or confirm fetal trisomy 21 from maternal blood samples. As an addition to noninvasive prenatal diagnostics, it is a risk-free alternative to common invasive examination methods such as amniocentesis. PraenaTest® is only available to pregnant women which are in the 12th week of pregnancy or later and which must have a higher risk of chromosomal alterations in the unborn child. Furthermore, in Germany, women with high-risk pregnancies will need to take advice and be informed without prejudice about human genetics by a qualified physician in accordance with the German Genetic Diagnostics Act and the guidelines of the Genetic Diagnostic Commission.

About LifeCodexx AG / www.lifecodexx.com

LifeCodexx AG, a subsidiary of GATC Biotech AG, is a German life science company focusing on the development of clinically validated molecular diagnostic tests based on the use of next generation sequencing techniques. Last year the company has partnered with Sequenom, Inc. (USA) for the commercialization of prenatal laboratory testing services in Europe

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GATC Biotech’s NightXpress sequencing service goes Europe-wide

Wed, 28 Mar 2012 11:26:00 +0200

New Cologne laboratories bring GATC Biotech closer to its customers

GATC Biotech, Europe’s leading sequencing provider, now offers its overnight sequencing service NightXpress Europe wide. This unique overnight service has been made possible by the recently opened European Custom Sequencing Centre in Cologne.

In the new laboratories GATC Biotech is focusing on Sanger Sequencing with ABI 3730xl. “We chose Cologne as a central location in Europe with the possibly best logistic link. We want to be closer to our customers to ensure shortest delivery times for highly competitive prices”, declares Peter Pohl, CEO of GATC Biotech.

On 420 square metres, with a fleet of Hamilton robotics and a 24-hour production the new laboratories are perfectly adjusted to the company’s fully automatic processing pipeline. These improvements make NightXpress available for all clients throughout all parts of Europe and guarantee the most convenient and fastest service.

In Constance, the company’s headquarters, GATC Biotech is building up the European Genome and Diagnostics Centre with focus on Next and Third Generation sequencing as well as on diagnostic services.

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GATC Biotech and LifeCodexx complete recruitment of blood samples for clinical study of trisomy 21 diagnostic test

Tue, 10 Jan 2012 11:49:00 +0100

Results of study to be available in the first quarter 2012

GATC Biotech AG and its subsidiary LifeCodexx AG successfully completed the recruitment of over 500 blood samples required for the clinical study of the non-invasive prenatal diagnostic test for the determination of trisomy 21 (LifeCodexx PraenaTest™). The prospective and blinded study evaluates this new molecular genetic method in comparison with conventional invasive methods and is based on the Next Generation sequencing of cell-free fetal DNA from maternal blood.

For the first time ever multiplexing the analysis on an Illumina HiSeq 2000 could be increased from previously seven to now twelve samples leading to increased cost efficiency. In addition, blood sampling and shipping was simplified, as the physician is no longer required to prepare the blood plasma before shipping and can now send the sample at ambient temperature.

The results of the study will be available in the first quarter of 2012. Then, following CE certification, the LifeCodexx PraenaTest™ will initially be introduced in German speaking countries in the second quarter of the year.

“We are very pleased to have the sample recruitment completed within six months. We sincerely thank all participating women and physicians for their support of the evaluation of this new diagnostic method,” said Dr. Michael Lutz, CEO of LifeCodexx AG. “We are very confident that the study will achieve the same positive results of previous pilot studies with regard to specificity and sensitivity. Then we will be able to offer a very reliable and safe diagnostic test to many women with high risk pregnancies, saving them from invasive prenatal methods.”

The clinical study was conducted jointly with several Central European prenatal diagnostics centers and scientists at GATC Biotech AG and LifeCodexx AG. Currently, the only reliable way of diagnosing chromosomal irregularities during pregnancy is to use invasive prenatal methods. This causes miscarriage in about one per cent of these risky surgical procedures.

GATC Biotech expands its sequencing laboratories in Constance and Cologne

Thu, 10 Nov 2011 12:05:00 +0100

30 new jobs are planned in 2012

Europe’s leading sequencing service provider GATC Biotech continues to grow in 2012. The company will expand the laboratories at its headquarters in Constance and plans to establish a new site in Cologne, Germany.

The premises in Constance will become the new European Genome and Diagnostics Center with GATC Biotech’s fleet of Next and Third Generation sequencing systems, such as Illumina HiSeq 2000 and Pacific Biosciences PacBio RS. There the company will focus on genome sequencing projects, offering its customers true multiplatform sequencing strategies. Furthermore, the laboratories of the daughter company LifeCodexx will be extended to provide the necessary capacity for the upcoming non-invasive molecular genetic prenatal diagnostic test for trisomy 21.

The new laboratory in Cologne will concentrate on single sample sequencing due to its central location in Europe and its excellent infrastructure. With the improved logistics and closeness to customers the company will be able to offer shortest delivery times and highly competitive prices.

GATC Biotech will therefore create more than 30 new jobs in in the coming year for both sites and grow to a total of 170 employees. Thus, the company’s workforce will have more than quadrupled since 2006.

“Rapidly developing new technologies and high price pressure are the key market drivers in our business. With our clear focus and strategy of consolidation we will meet the new challenges successfully. I would like to express my gratitude to all our employees who are actively supporting the decisions and drive them forward with highly motivated spirit,” says Peter Pohl, CEO of GATC Biotech and Chairman of the Supervisory Board of LifeCodexx AG.

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Sequenom annonce un contrat de licence européen avec la filiale de GATC LifeCodexx

Thu, 11 Aug 2011 11:48:00 +0200

San Diego, Californie/Constance, Allemagne – Sequenom, Inc. (NASDAQ: SQNM), une entreprise de biotechnologie qui propose des solutions innovantes d’analyse génétique, annonce aujourd’hui qu’elle s’associe à LifeCodexx AG, une entreprise développant des diagnostics moléculaires de la nouvelle génération validés cliniquement dans le but de commercialiser en Europe des tests prénatals en laboratoire. Les entreprises ont conclu un accord de collaboration pour développer et lancer un test de trisomie 21 développé en laboratoire ainsi que d’autres diagnostics d’aneuploïdisation en Allemagne, en Autriche, en Suisse et au Lichtenstein, et envisagent d’autres lancements dans d’autres pays.

La signature du contrat avec LifeCodexx scelle le premier partenariat commercial européen de Sequenom dans le domaine des diagnostics prénatals non-invasifs. Selon les termes de ce premier contrat de licence de cinq ans, Sequenom accorde à LifeCodexx des licences de brevets essentiels dont le brevet européen EP0994963B1 et le brevet en attente de délivrance EP2183693A1 qui permettent le développement et la commercialisation de diagnostics d’aneuploïdisation non-invasifs utilisant l’ADN fœtal acellulaire circulant dans le plasma maternel. Suivant le contrat, LifeCodexx paiera à l’avance un montant minimum annuel de droits d’auteur à Sequenom ainsi que des droits d’auteur sur la vente de services d’analyse.

« Ce contrat nous permet d’étendre au niveau international les droits de licences à nos propres modalités de diagnostics et nous sommes ravis d’avoir pour partenaire dans cette entreprise un laboratoire de la qualité de LifeCodexx . » a déclaré Harry F. Hixson, président-directeur général de Sequenom, Inc. « Il s’agit de notre premier contrat de licence hors USA permettant à un partenaire de commercialiser le test de trisomie 21 développé en laboratoire, c’est une nouvelle étape consistant à lancer ce test sur le marché et à réaliser les objectifs que nous nous sommes fixés pour 2011. »
« Nous sommes heureux d’être le premier partenaire de Sequenom et de fournir pour la première fois des services d’analyses dans les pays germanophones du marché européen. Nous sommes actuellement très bien placés pour exploiter l’utilité clinique et notre know-how en matière de détection non-invasive de la trisomie 21 et d’autres aneuploïdisations utilisant le séquençage « shotgun » tel qu’il a été développé au départ par le Dr Dennis Lo et son équipe », ajoute Dr Michael Lutz, directeur général de LifeCodexx AG. « Basé sur notre étude de validation clinique récemment mise en place pour les tests de trisomie 21, ce contrat est une autre étape clé pour atteindre notre objectif, à savoir le lancement de notre premier test fin 2011. »

About Sequenom
Sequenom, Inc. (NASDAQ: SQNM) is a life sciences company committed to improving healthcare through revolutionary genetic analysis solutions. Sequenom develops innovative technology, products and diagnostic tests that target and serve discovery and clinical research, and molecular diagnostics markets. The company was founded in 1994 and is headquartered in San Diego, California. Sequenom maintains a Web site at www.sequenom.com to which Sequenom regularly posts copies of its press releases as well as additional information about Sequenom. Interested persons can subscribe on the Sequenom Web site to email alerts or RSS feeds that are sent automatically when Sequenom issues press releases, files its reports with the Securities and Exchange Commission or posts certain other information to the Web site.

About LifeCodexx
LifeCodexx is a subsidiary of GATC Biotech, Europe´s leading provider of DNA sequencing services. The company focuses on the development of clinically validated next generation molecular diagnostics by applying its expertise in the field of next generation sequencing. The current focus is on prenatal diagnostics.

Forward-Looking Statements
Except for the historical information contained herein, the matters set forth in this press release, including statements regarding expectations for the commercialization of prenatal laboratory testing services in Europe including a trisomy 21 laboratory developed test and other aneuploidy tests, the duration of and collaboration, performance, sales and payment expectations under the licensing agreement, the potential for additional launches in other countries, bringing a trisomy 21 test to market, Sequenom’s corporate goals for 2011, and Sequenom’s commitment to improving healthcare through revolutionary genetic analysis solutions, are forward-looking statements within the meaning of the “safe harbor” provisions of the Private Securities Litigation Reform Act of 1995. These forward-looking statements are subject to risks and uncertainties that may cause actual results to differ materially, including the risks and uncertainties associated with reliance upon the collaborative efforts of other parties such as LifeCodexx, Sequenom’s and its partner’s ability to develop and commercialize new technologies and products, particularly new technologies such as prenatal and other diagnostics and laboratory developed tests, Sequenom’s ability to manage its existing cash resources or raise additional cash resources, competition, intellectual property protection and intellectual property rights of others, government regulation particularly with respect to diagnostic products and laboratory developed tests, obtaining or maintaining regulatory approvals, ongoing litigation and investigations and other risks detailed from time to time in Sequenom, Inc.’s most recent Annual Report on Form 10-K and other documents subsequently filed with or furnished to the Securities and Exchange Commission. These forward-looking statements are based on current information that may change and you are cautioned not to place undue reliance on these forward-looking statements, which speak only as of the date of this press release. All forward-looking statements are qualified in their entirety by this cautionary statement, and Sequenom, Inc. undertakes no obligation to revise or update any forward-looking statement to reflect events or circumstances after the issuance of this press release.

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GATC Biotech et l'EHT de Zurich mettent au point une méthode d'assurance qualité dans la production alimentaire

Thu, 21 Jul 2011 12:16:00 +0200

La méthode se base sur le séquençage multiplateformes incluant le nouveau système PacBio RS.

En collaboration avec l'institut des Sciences alimentaires, Nutrition et Santé de l'Ecole polytechnique fédérale de Zurich (ETH, Zurich), la GATC Biotech développe une méthode économique de caractérisation taxonomique des communautés microbiennes colonisant les aliments.

Réalisée dans les locaux de la GATC Biotech à Constance, cette application liée à l'industrie vise à étudier les causes de l'altération du fromage pendant sa production industrielle et analyse la complexité des populations bactériennes, permettant ainsi une meilleure compréhension générale de l'altération des denrées alimentaires.

GATC Biotech mettra en place de nouvelles méthodes d'assurance qualité, fournissant ainsi de précieuses informations relatives au contrôle de la qualité et à la sécurité alimentaire, à l'optimisation des rendements de production, ainsi qu'aux processus de production alimentaire. Cette méthode d'assurance qualité sera applicable à de nombreux autres domaines de production industrielle d'aliments pour animaux et de denrées alimentaires, par ex. pêcheries, boucheries, brasseries et partout où la production se base sur la formation dirigée de systèmes écologiques microbiens complexes dans les denrées.

"Ce projet sera réalisé grâce à un séquençage multiplateformes, qui aura recours à toutes les principales techniques de séquençage, y compris notre dernière acquisition, le PacBio RS de Pacific Biosciences", explique Dr. Kerstin Stangier, directrice du développement commercial à la GATC Biotech. "Grâce à cette nouvelle technologie de séquençage de troisième génération, l'ADN et l'ARN d'un consortium de population microbienne peuvent être séquencés à la fois - tout comme peuvent être effectués le séquençage et la caractérisation de l'épigénome. Nous sommes donc en mesure de fournir une méthode économique, à la fois en temps et en coûts, et restons fidèles à notre objectif déclaré d'offrir à nos clients la meilleure solution possible pour leurs projets de séquençage."

Le Metatxn Project est soutenu par le BMWi (Ministère fédéral de l'Economie et de la Technologie) à hauteur d'environ 120.000 euros.

L'étude de validation clinique pour le test de diagnostic prénatal non invasif de la trisomie 21 a bien commencé

Tue, 28 Jun 2011 07:00:00 +0200

Méthode sur Illumina HiSeq 2000 validée

En collaboration avec plusieurs centres natals d'Europe Centrale, les scientifiques de GATC Biotech AG et de LifeCodexx AG ont commencé l'étude de validation clinique pour un test de diagnostic prénatal non invasif, s'appuyant sur les techniques de séquençage de nouvelle génération.

Le test permet de mettre en évidence de façon fiable une trisomie 21 foetale (down syndrom) et se base sur le séquençage d'ADN foetal exempt de cellules du sang maternel. Plus de 150 échantillons ont pu être recueillis en très peu de temps. Pour l'étude cependant, ce sont au moins 500 échantillons qui sont nécessaires. Afin d'améliorer la rentabilité et la productivité, la méthode avait d'abord été validée avec succès au moyen du système de séquençage de nouvelle génération Illumina HiSeq 2000 avec 38 échantillons.

"Notre méthode permet le pooling d'au moins sept échantillons en analyse parallèle au moyen du HiSeq 2000", a expliqué le Dr. Michael Lutz, CEO de LifeCodexx AG, "ce qui abaisse les coûts de plus de 50 pour cent par échantillon analysé. Nous sommes parfaitement dans les temps avec notre étude de validation clinique et pourrons lancer le test de diagnostic prénatal fin 2011, comme prévu."

La GATC Biotech et LifeCodexx présenteront les résultats des études qu'elles auront réalisées jusque là au World Congress de médecine foetale à Malte au moins de juin, ainsi qu'à la conférence de l'Association de cytogénétique européenne à Porto au mois de juillet.

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GATC Biotech et LifeCodexx mettent au point un test diagnostique pour le dépistage précoce de la préclampsie

Thu, 12 May 2011 09:43:00 +0200

Le projet est subventionné par le BMBF à hauteur de 500.000 euros

La préclampsie est un trouble hypertensif de la mère pendant la grossesse. Elle compte parmi les causes de décès les plus fréquentes de la mère et du bébé à naître, soit une incidence d'environ deux à cinq pour cent de toutes les grossesses en Allemagne. Un dépistage précoce est déterminant et améliore le pronostic du déroulement ultérieur de la grossesse.

Sur la base des techniques de séquençage de nouvelle génération, la GATC Biotech va maintenant développer en collaboration avec LifeCodexx un test diagnostique de génétique humaine permettant de détecter l'ADN foetal exempt de cellules comme un marqueur important du dépistage précoce. Le test permettra de calculer le risque d'une manière fiable dès la phase présymptomatique d'une grossesse. Le projet sera subventionné par des fonds du programme d'innovation KMU du ministère fédéral de la recherche et de la formation à hauteur de 500.000 euros pendant les deux prochaines années.

"Il n'existe actuellement aucune méthode fiable de détecter la préclampsie. Le nouveau test génétique permettra donc une plus grande sécurité et cela, dès le début de la grossesse", commente Madame le Dr. Wera Hofmann, directeur médical de LifeCodexx AG.

"Pour ce projet, nous allons vérifier incessamment dans quelle mesure le nouveau système de séquençage PAcBio RS peut être utilisé. Ce système de troisième génération analyse les molécules individuellement en temps réel en l'espace de quelques minutes. Ainsi pourrait-on encore une fois réduire considérablement le coût et la durée du test diagnostique", ajoute Peter Pohl, CEO de la GATC Biotech et président du conseil d'administration de LifeCodexx.

"Nous sommes fiers d'avoir mis au point outre le test de détection de la trisomie 21 un deuxième test diagnostique prénatal non invasif en l'espace d'une année. Nous nous sommes sensiblement rapprochés de notre objectif de devenir un leader dans le domaine du diagnostic moléculaire de nouvelle génération", conclut Dr. Michael Lutz, CEO de LifeCodexx AG.

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Etude pilote d'un test de diagnostic prénatal non invasif de la trisomie 21

Thu, 14 Apr 2011 09:36:00 +0200

Commercialisation prévue : fin 2011

Jusqu'à présent, les anomalies chromosomiques pendant la grossesse ne pouvaient être diagnostiquées de façon fiable que par des méthodes prénatales invasives. Dans environ un pour cent des cas, ces interventions non dénuées de risques entraînaient un avortement spontané.

En collaboration avec le centre de diagnostic prénatal et de génétique humaine Kudamm-199 à Berlin, des scientifiques de la GATC Biotech AG et de la LifeCodexx AG ont développé un test de diagnostic non invasif fiable sur la base du séquençage de nouvelle génération, permettant de mettre en évidence une éventuelle trisomie 21 foetale (syndrome de Down). Le test s'appuie sur le séquençage d'ADN foetal exempt de cellules du sang maternel et pourrait à court terme constituer une alternative dénuée de risque à des examens prénatals invasifs comme l'amniocentèse tels qu'ils sont utilisés aujourd'hui.

Dans le cadre d'une étude pilote, une méthode d'analyse se basant sur les travaux de Chiu et al. a été développée et vérifiée par plus de quarante échantillons cliniques. Des analyses au moyen du système de séquençage de nouvelle génération Illumina Genome Analyser IIx ont ainsi mis en évidence huit échantillons positifs. La sensibilité et la spécificité du test ont été de 100 % pour tous les échantillons. Les résultats ont été confirmés par une caryotypisation conventionnelle.

Les résultats de cette étude pilote sont très prometteurs. D'un point de vue clinique et particulièrement chez les femmes dont la grossesse est à risque, le test pourrait être utilisé relativement rapidement et compléter les procédés non invasifs déjà existants pour détecter les anomalies chromosomiques, a déclaré le maître de conférence Dr. Markus Stumm du centre berlinois de diagnostic prénatal qui a présenté les résultats de l'étude pilote au congrès annuel de la société allemande de génétique humaine à Regensburg (Allemagne) en mars dernier.

"Actuellement, le diagnostic prénatal au moyen de séquençage multiplex est encore très coûteux. Afin de réduire les coûts au maximum, nous développons maintenant une méthode permettant le pooling de plusieurs échantillons parallèlement à l'analyse au moyen du système de séquençage Illumina HiSeq2000," a expliqué Peter Pohl, CEO de la GATC Biotech AG et président du conseil d'administration de la LifeCodexx AG.

"Le développement de cette méthode sera bientôt terminé. L'étude de validation clinique avec un minimum de 500 échantillons pourra donc immédiatement commencer. Nous sommes convaincus qu'elle sera également couronnée de succès. Notre premier test de diagnostic prénatal pourrait alors être commercialisé dès fin 2011," a annoncé le Dr. Michael Lutz, CEO de la LifeCodexx AG.

Ce projet a été subventionné par les fonds BMBF des programmes ZimSolo et KMU Innovativ.

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Une fois de plus, la société GATC Biotech Ltd a été reconnue fournisseur préféré des conseils de recherche au Royaume-Uni

Fri, 25 Feb 2011 11:58:00 +0100

Comme en 2006 où la société avait déjà remporté le titre, la GATC Biotech Ltd (Londres) a été à nouveau sélectionnée fournisseur préféré pour le séquençage d'ADN par les Research Councils UK Shared Services Centre Ltd (RCUK SSC Ltd).

Jusqu'à la fin 2012. La société fournira ses services de séquençage en lecture simple à tous les laboratoires RCUK, parmi lesquels le Medical Research Council (MRC), le Institute of Animal Health (IAH), le Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), et le Natural Environment Research Council (NERC) pour n'en nommer que quelques-uns.

Le service de nuit unique en son genre NightXPress a été l'un des arguments déterminants pour sélectionner la GATC Biotech basée à Londres parmi de nombreuses autres entreprises internationales. Il s'agit en effet d'un service de séquençage de nuit "5-to-9" qui permet de réduire le temps de livraison des résultats à seulement 16 heures à compter du moment où l'échantillon est ramassé.

Richard Fowles du RCUK SSC Ltd a commenté la distinction en ces termes : "La GATC Biotech est notre fournisseur préféré de séquençage d'ADN depuis 2006. Nous apprécions leurs qualités de fiabilité et d'innovation depuis de nombreuses années. Grâce à NightXpress, ils sont en mesure de fournir un service extrêmement rapide qui permet à nos chercheurs un gain considérable de temps."

Mayor Horst Frank: GATC is a Constance flagship company

Thu, 27 Jan 2011 17:00:00 +0100

The GATC Biotech management and employees welcomed local political and industrial leaders, the architect, and construction companies to celebrate the inauguration of the newly constructed GATC facilities in Constance.

For Mayor Horst Frank GATC Biotech is a model company for the area. He looks forward to many imitators, "Being an innovation leader, GATC Biotech helps to establish the Lake Constance region as a center for industrial innovation.”

“We are very glad to have the extra laboratory and office space,” says CEO Peter Pohl,” finally we have enough room to realize our plans and ideas in the future.”

From 2009 to 2012 GATC Biotech will have invested more than five million Euros in its Constance site. By the end of 2011 the workforce will be increased from currently 120 to 140 employees.

La société GATC Biotech ouvre son troisième laboratoire de séquençage en Europe

Wed, 17 Nov 2010 10:01:00 +0100

Les nouvelles installations seront situées à Düsseldorf, Allemagne

Le nouveau laboratoire de séquençage de la GATC Biotech sera également le deuxième en Allemagne et sera aménagé dans le Life Science Center de Düsseldorf. Les nouvelles installations permettront à des scientifiques du nord de l'Allemagne et des pays voisins de bénéficier du service NightXpress, un service spécial de nuit introduit en 2007. Ce service de séquençage d'échantillons simples réduit les temps de livraison à pratiquement une demi-journée à compter du prélèvement des échantillons. Le nouveau laboratoire sera soumis aux mêmes normes rigoureuses de qualité et d'automatisation que les laboratoires de la maison mère de la GATC Biotech à Constance (Allemagne). Il entrera en fonction le 4 janvier 2011.

Jochen Schäfer, directeur du département de Custom Sequencing à la GATC Biotech, commente : "Nous enregistrons un besoin croissant de services de séquençage dans des délais de plus en plus courts. Il est donc pour nous essentiel d'être proche de nos clients. Le Life Science Center de Düsseldorf offre une infrastructure et un lieu géographique parfaits."

About the Life Science Center Düsseldorf

The Life Science Center Düsseldorf (LSC) is the technology and entrepreneur center for Düsseldorf in Life Sciences (e.g. Biotechnology, Medical and Pharmaceutical Science) and further technologies.

The LSC supports founders, young enterprises and research institutions in turning their scientific know-how into a marketable product or process. This also applies to companies that are already successful in the marketplace and wish to expand. The LSC consists of two buildings that perfectly complement each other: the Technology Center with laboratory infrastructure (S2 standard) and associated offices. Vis á vis the representative Office Building, in which the service companies can assist and support the companies located in the Technology Center.

GATC subsidiary LifeCodexx appoints Head of Commercial Operations

Tue, 02 Nov 2010 15:48:00 +0100

Former Brahms sales manager boosts LifeCodexx team

LifeCodexx AG announces that Dr. Martin Burow, a proven expert in the field of prenatal diagnostics, has joined its team as Head of Commercial Operations. www.lifecodexx.com/en/news.html

GATC Biotech envisage de séquencer 100,000 génomes humains d'ici 2014

Fri, 24 Sep 2010 12:25:00 +0200

PacBio RS s'avère précieux pour les études sur les variantes rares et les variations structurelles et patrons de méthylation

La société GATC Biotech prévoit au cours des quatre prochaines années d'analyser 100,000 génomes humains, notamment pour l'industrie pharmaceutique et du diagnostic, ainsi que pour la recherche universitaire. Pour cela, GATC Biotech s'appuiera sur les techniques Illumina’s HiSeq 2000, ainsi que sur son acquisition la plus récente, la plateforme PacBio RS de séquençage d'une seule molécule.

Pour réaliser cet objectif, la GATC Biotech élargira son portfolio d'activités en ouvrant une unité commerciale pour l'analyse du génome humain. Cette nouvelle unité stratégique est située au quartier général allemand de la société et se consacre au séquençage et à l'analyse bioinformatique d'échantillons humains de toutes tailles ; depuis de petites régions enrichies jusqu'à des génomes entiers.

“D'ici à fin 2010, nous aurons analysé plus de 100 génomes humains, un nombre encore plus élevé que ce que nous avions annoncé en 2007,” commente Dr. Kerstin Stangier, directrice du développement des affaires et chef de la nouvelle unité commerciale. “Grâce à notre expérience et à notre savoir-faire, nous sommes à même d'offrir une flexibilité et une qualité maximales, ainsi que des temps de livraison courts. La nouvelle unité commerciale comprend un workflow de production contrôlé par un LIMS avec une bibliothèque de préparation automatisée et un vaste pipeline bioinformatique pouvant être adapté à tout objectif de projet. Les collaborations actuelles, par exemple avec le consortium international sur la génomique du cancer, ont été très utiles pour le développement de ce pipeline.”

GATC Biotech est le fournisseur de services de séquençage leader en Europe. La société a plus que doublé son personnel pendant les trois dernières années et compte actuellement presque 120 employés.

GATC Biotech devient le premier fournisseur de services européen du PacBio RS

Wed, 22 Sep 2010 10:54:00 +0200

Le séquenceur RS en temps réel d'une seule molécule de Pacific Biosciences devrait être installé à Constance début 2011

La société GATC Biotech a aujourd'hui annoncé qu'elle avait accepté d'acheter la plateforme PacBio RS, une technique de séquençage en temps réel (SMRT™) d'une seule molécule. Le nouveau PacBio RS sera la cinquième technique de séquençage de la GATC Biotech. Il est prévu d'installer le système début 2011.

La GATC Biotech envisage d'utiliser cette nouvelle plateforme pour résoudre les variations structurelles, par exemple dans les génomes du cancer humain, ainsi que pour détecter et confirmer les SNPs rares. En outre, la future application permettant le séquençage direct de bases méthylées, elle rendra le système plus attractif pour les études régulières, par exemple pour l'industrie pharmaceutique ou du diagnostic.

"Pacific Biosciences a choisi GATC Biotech comme premier fournisseur de services européen car la société est réputée pour sa formidable expérience dans les principales techniques de séquençage dans une vaste gamme de projets et pour adapter rapidement les nouvelles techniques de séquençage à la routine de laboratoire", commente Terry Pizzie, vice-président, Europe pour Pacific Biosciences.

"Nous sommes impatients d'offrir à nos clients la plateforme de séquençage de troisième génération PacBio et sommes persuadés que nous pourrons offrir la technique SMRT à nos clients dans un proche avenir après une installation réussie", ajoute Thomas Pohl, directeur technique de GATC Biotech.

GATC Biotech est le fournisseur de services de séquençage leader en Europe. La société a plus que doublé son personnel pendant les trois dernières années et compte actuellement presque 120 employés.

GATC Biotech purchases second Illumina HiSeq 2000

Wed, 07 Jul 2010 15:21:00 +0200

GATC Biotech today announced the acquisition of an additional Illumina HiSeq 2000 sequencing platform. The new system will be ready for production within July, just a few months after the first system has been successfully taken into operation. Due to the high cost-effectiveness and sequencing output the company uses the HiSeq 2000 systems mainly for sequencing pediatric brain tumors within the International Cancer Genome Consortium (ICGC), for large population studies and complex screenings of mutations which cause rare diseases. The new acquisition increases GATC Biotech's sequencing capacity to nearly twenty terabases per year.

GATC Biotech séquence des tumeurs cérébrales pédiatriques pour le consortium international sur le génome du cancer (ICGC)

Tue, 18 May 2010 06:33:00 +0200

En collaboration avec le DKFZ / Le projet PedBrain Tumor est financé par le BMBF et la Deutsche Krebshilfe

La GATC Biotech va séquencer des prélèvements de tumeurs cérébrales pédiatriques dans le cadre du plus grand projet international de recherche sur les pathologies cancéreuses sous la houlette de l'ICGC ; le consortium allemand PedBrain Tumor a pour mission de développer des procédures diagnostiques et autres thérapies innovatrices visant à l'avenir à limiter les effets secondaires des traitements chez les enfants.

La GATC Biotech séquence des génomes issus de tissus tumoraux, ainsi que les contrôles correspondants issus de l'ADN des mêmes patients. On aura pour cela recours aux technologies de séquençage d'Illumina Inc, entre autres au nouvel Illumina HiSeq 2000. Avec jusqu'à 200 gigabases par run, cet appareil constitue actuellement le système le plus efficace de séquençage. Pour une interprétation fiable des données, les génomes complets seront séquencés avec une couverture de 30 fois. Les données seront transmises au DKFZ à l'automne 2010. Le volume de commande s'élève à 750.000 euros.

"Les tumeurs cérébrales sont la principale cause de décès par cancer chez les enfants. Des thérapies avec des effets secondaires les plus limités possibles sont indispensables pour faciliter le traitement, déjà lourd, chez les enfants. En développant de telles thérapies, le projet PedBrain Tumor permettra un grand pas en avant. La GATC Biotech a déjà prouvé qu'elle était un partenaire de séquençage fiable pendant la phase pilote du projet ; ainsi allons-nous poursuivre notre collaboration", a commenté le professeur Peter Lichter, chef de projet et porte-parole de l'ICGC.

"Nous sommes très conscients de l'importance de ce projet et de la responsabilité qui nous incombe. En même temps, nous sommes très fiers de pouvoir collaborer avec le DKFZ dans le cadre du projet PedBrain Tumor," a exposé Peter Pohl, CEO de la GATC Biotech.

Le consortium PedBrain Tumor, une participation allemande aux travaux du consortium international sur le génome du cancer (ICGC), sera subventionné pendant cinq ans par le ministère fédéral de l'Enseignement et de la Recherche (BMBF) et la ligue allemande de lutte contre le cancer (DKFZ) à hauteur de 15 millions d'euros. Ces travaux sur l'étiologie génétique moléculaire des tumeurs cérébrales pédiatriques sont dirigés par le centre allemand de recherche sur le cancer (DKFZ). Les chercheurs expèrent que les résultats leur permettront de développer des thérapies innovatrices.

Le DKFZ
Le centre allemand de recherche sur le cancer (DKFZ) est le centre de recherche biomédical le plus important d'Allemagne et est membre de la communauté des centres allemands de recherche Helmholtz. Plus de 2000 collaborateurs et collaboratrices, dont 850 scientifiques, analysent les mécanismes d'apparition du cancer et s'efforcent de répertorier les facteurs de risque du cancer. Ainsi participent t-ils à la mise en place de nouvelles approches dans la prévention, le diagnostic et la thérapie des pathologies cancéreuses. Qui plus est, les collaborateurs et collaboratrices du centre d'information informent les patients, leurs familles et toutes les personnes intéressées sur le cancer, aujourd'hui l'une des principales causes de mortalité. Le centre est financé à 90 pour cent par le ministère fédéral de l'Enseignement et de la Recherche et à 10 pour cent par le land du Bade-Wurtemberg.

LifeCodexx AG, filiale de GATC, développe des tests de diagnostic prénatal

Wed, 28 Apr 2010 13:27:00 +0200

Projet bénéficie de subventions publiques / Ancien directeur de Cogenics devient CEO
La société LifeCodexx AG a commencé des travaux opérationnels de recherche et de développement de tests diagnostiques validés cliniquement au moyen de technologies de séquençage nouvelle génération. Les travaux concernent actuellement le diagnostic prénatal. Forte des 20 ans d'expérience de GATC Biotech, LifeCodexx a également recours au laboratoire de séquençage de cette dernière qui, avec une capacité totale de plus de 2 terabases par an, est le leader européen.

La société LifeCodex AG souhaite avec ses travaux de "Next Generation Molecular Diagnostics" s'établir durablement en Europe. Ses tests permettront un meilleur diagnostic pour des thérapies ciblées d'un bon rapport coût-efficacité. La société appartient majoritairement à la GATC Biotech AG, ainsi qu'à des investisseurs privés. La mise au point des tests actuels sera également subventionnée entre autres par les programmes publics de soutien ZIMSolo et KMU Innovativ à hauteur de max. 300.000 euros.

Le nouveau CEO de LifeCodexx AG est le Dr. Michael Lutz, ancien Global General Manager de Cogenics et CEO d'Epidauros AG, qui est loin d'être un novice en la matière. Dr. Lutz a en effet a son actif de longues années d'expérience dans le développement et la direction d'entreprises innovatrices de BioTech.

"La mise au point de nouveaux tests diagnostiques de génétique humaine sur la base des technologies de séquençage les plus modernes est un concept révolutionnaire. Ainsi le rapport coût-efficacité du diagnostic va-t-il pouvoir être considérablement amélioré. La société LifeCodexx AG fait ici figure de pionnier," s'enthousiasme Peter Pohl, CEO de la GATC Biotech et président du comité de surveillance de la LifeCodexx AG.

"Notre pipeline de test de diagnostic prénatal montre des résultats très prometteurs que nous présenterons dans les mois suivants. Je suis heureux de pouvoir mettre mon expérience au service de ces projets innovateurs", poursuit le Dr. Michael Lutz, nouveau CEO de la LifeCodexx AG.

Contact:

LifeCodexx AG

Dr. Michael Lutz

Chief Executive Officer

m.lutz@lifecodexx.com

+49 (0) 7531 81 60 15

BioLago paves the way for a new project for breast cancer therapy

Thu, 04 Mar 2010 15:21:00 +0100

German-Austrian cooperation within the life science network at Lake Constance | Hope for breast cancer patients – under the leadership of the Vorarlberg Institute for Vascular Investigation and Treatment (VIVIT), a cross border cooperation is to start between hospitals and bioanalytical laboratories of the Rhine Valley and Lake Constance region. It is aimed at exploring the influence genetic material (DNA) has on the progression of breast cancer and the response to breast cancer treatment. A collaboration, which became possible thanks to the BioLAGO association.

Over the past few years, the range of treatment options for breast cancer has improved significantly. A number of therapies using new drugs will become available in the foreseeable future. Not every patient, however, responds well to these therapies. The course of disease can therefore vary considerably from one person to another, causing severe side effects in some patients. One reason for these individual differences lies in the variability of our genetic material, the DNA.

In cooperation with the Feldkirch District Hospital (Landeskrankenhaus Feldkirch) and the Lake Constance Breast Centre (Brustzentrum Bodensee) represented by the Gynaecological Hospital at the Constance Hospital (Klinikum Konstanz) as well as GATC Biotech AG, Constance, genetic alterations which influence, for example, the effect of drugs are analysed on the basis of comprehensive and well characterised patient groups, using state-of-the-art laboratory techniques. “By means of tissue and blood samples, we will carefully examine certain patient DNA regions which may influence the mechanism of action or the metabolism of drugs,” explains Axel Mündlein, Head of Laboratory at VIVIT in Dornbirn.

Fewer side effects due to optimal forms of therapy

Information gained from the genetic analysis of a breast cancer sufferer should help to derive a therapeutic approach which is best suited to the individual patient. Likewise, treatments to which patients do not respond should be excluded early on and avoidable side effects and unnecessary cost to the health care system should be reduced significantly. First results should become available by 2011, and the project is due to be completed by mid-2013. The project is co-financed with funds from the EU and the Interreg IV-Programme "Alpenrhein-Bodensee-Hochrhein".

BioLAGO Association got the ball rolling

“Without the BioLAGO-platform this project wouldn´t exist “, states Axel Mündlein. The idea for the project was borne when Mündlein and Peter Pohl, CEO of GATC, a biotechnology company in Constance, met and exchanged views at an event organised by the BioLAGO-network. About a year ago the two members first came into contact within the network for modern life sciences. According to the geneticist Mündlein the advantages of the cooperation are obvious: “GATC has the latest technologies to decode the human genome at its disposal, and, in addition, the geographical proximity facilitates effective cooperation “, explains Mündlein.

The cooperation is dominated by the concept of BioLAGO, an association founded in 2007. Since mid-2008, the international network has a central office at the Technology Centre Constance and is working intensively on bringing together researchers, entrepreneurs and medical practitioners to develop new projects and products as well as to strengthen the economic position of the region. “This project proves that the integration of research and business sector within the frame of an industry –specific platform is bearing fruit “, observes Andreas Baur, CEO of BioLAGO.

VIVIT (Vorarlberg Institute for Vascular Investigation and Treatment)

VIVIT ist ein privater gemeinnütziger Trägerverein zur Forcierung der angewandten medizinischen Forschung in der Region Vorarlberg. Schwerpunkte der Forschung des VIVIT sind Diabetes mellitus, Herzerkrankungen, Beingefäßerkrankungen und Schlaganfall sowie Themen aus der Onkologie und Nephrologie. Hierbei können alle Fachrichtungen auf Analysedienstleistungen eines eigens dafür eingerichteten molekularbiologischen Labors zurückgreifen, um u.a. erbliche bedingte Prädispositionen für Erkrankungen in den genannten Bereichen zu untersuchen. Neben seinen Forschungstätigkeiten führt das VIVIT klinische Studien im Auftrag überregionaler Unternehmen am akademischen Lehrkrankenhaus Feldkirch durch. Das VIVIT gehört im Bereich der vaskulären Forschung österreichweit zu den aktivsten Instituten und liegt europaweit derzeit im Spitzenfeld. (Kontakt: Dr. Axel Mündlein, Tel.: +43 5572 372 65 81, Fax +43 5572 372 65 84, labor@vivit.at)

GATC Biotech orders Europe’s first HiSeq 2000 for commercial use

Thu, 21 Jan 2010 15:55:00 +0100

Illumina’s latest sequencing system to be installed in the Constance laboratories

GATC Biotech today announced the purchase of Illumina’s new HiSeq 2000 sequencing platform, which has officially been launched last week. This latest acquisition will further strengthen GATC Biotech’s current fleet of three GA IIx.

Initially, the company will employ the HiSeq 2000 to human genome sequencing projects from its customers in the pharmaceutical and medical research field. It will also make the system’s high data output available to the industrial and academic research community interested in the high throughput sequencing of larger eukaryotic genomes.

“Illumina’s HiSeq 2000 with the estimated output of 200 GB per run allows us to virtually sequence 60 human genomes at 1x coverage in a week. Being an Illumina CSPro certified service provider we are confident to have the system quickly installed and geared up for production,” says Peter Pohl, CEO of GATC Biotech.

The HiSeq 2000 sequencing system had just been launched by llumina Inc. on the occasion of the J.P. Morgan Healthcare Conference last week in San Diego.