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Toutes les techniques de séquençage de pointe dans un laboratoire
GATC utilise les trois techniques de séquençage de pointe à haut débit:
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ABI 3730XL
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Illumina Genome Analyzer
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Roche GS FLX
Ces nouvelles techniques associées à l’expérience de séquençage de GATC de presque deux décennies vous offrent un kit d’outillage polyvalent et puissant qui vous permettra de choisir la meilleure méthode pour votre projet spécifique.
Next Generation Bioinformatics Services
Data analysis for Next Generation sequencing data (PDF)
Next-Gen Analysis and Utility The combination of different technologies and bioinformatics tools provide the best results (PDF)
Analyses and visualisation of sequence data from Roche GS FLX, Illumina Genome Analyzer and ABI 3730XL
Next Generation Sequencing and Bioinformatic Services at GATC (PDF)
Technical specification sheets

Choisissez la technique adaptée à votre projet! Bénéficiez de notre expérience pour mettre en place des solutions complètes de séquençage et des logiciels pour satisfaire vos exigences individuelles!
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Technique de séquençage Sanger sur ABI 3730XL (Applied Biosystems/Sanger)
+ Longueurs de lecture élevées: jusqu’à 1 100 bases/lecture + Backbone/séquençage échafaudage
- highly accurate reads
- backbone/scaffold sequencing
Premier choix pour les projets de finition ; séquençage d’ADNc de pleine longueur; séquençage d’échantillons uniques.
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Pyroséquençage sur GS FLX (Roche/454)
+ Longueurs de lecture de 250 bases/lecture
+ 100 MB/400 000 lectures par parcours
- Séquençage facile d’organismes avec contenu élevé en GC
- Bibliothèques sans le biais du clonage dans les régions riches en AT
Optimal pour l’analyse détaillée de transcriptomes entiers ; génomes bactériens ;petits génomes eucaryotiques.
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Analyseur génétique 1G (Illumina/Solexa)
+ micro lectures de 36 bases/lecture + 1 000 MB/40 000 000 lectures par parcours
- Nombre extrêmement élevé de données en peu de temps
- Préparation simple des échantillons
Extrêmement intéressant pour les projets de reséquençage tels que les souches de production ; petits ARN, SAGE et ChIP; séquençage ultra profond de SNP ou mutations. |
Analyse des données bioinformatiques
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Les nouvelles techniques produisant des sommes colossales de données brutes, l’analyse des données bioinformatiques constitue un défi primordial.
La société GATC offre une vaste plate-forme bioinformatique consistant en de puissantes capacités d’assemblage et d’annotation permettant de répondre à ces besoins futurs:
- Visualisation in Genome Browser
- Whole genome alignments
- Proprietary repeat handling
- SNP report
- Proprietary indel analysis
- Coverage visualisation
- FASTA files
- Base quality scores
- Transcriptome tag analysis
- ChIP-Seq analysis
- Sequencing run quality analysis & statistics report
- De novo assembly
- Whole genome mapping
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Qualifications de la GATC
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- Presque deux décennies d’expérience avec de génome pour les besoins universitaires et industriels dans le monde entier.
- Certification ISO 9001:2000 garantissant des standards de qualité de production les plus élevés.
- Références de projets de génomes
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Plus d'information des techniques de séquençage de pointe à haut débit
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