Analyse de régulome
ARNmi, ARNsi, ARNtn et analyse ChIP
Les petits ARNs (small RNAs) sont de courtes molécules comptant 21 à 28 nucléotides. On les trouve dans les cellules eucaryotiques aux côtés de l’ARN avec les fonctions ARNmi, ARNsi, ARNtn ; ils remplissent des fonctions importantes dans la régulation de processus cellulaires comme la régulation de croissance, la différenciation, l’apoptose, le développement du cancer et la neurogénèse. Malgré leur origine et leur fonction semblables, ils portent souvent un autre nom et se répartissent en différentes classes, par ex. ARNsmi (micro ARNs), ARNsi (ARNs short interfering : à courte interférence), ARNstn (tiny non-coding RNAs : ARNs minuscules non codants).
L’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) est une méthode in vivo permettant d’identifier les sites de fixation des protéines à une séquence d’ADN. Le fait de connaître les interactions entre protéines et ADN est important pour mieux comprendre de nombreux processus biologiques, ainsi que diverses maladies. Alors que la méthode établie de l’analyse ChIP au moyen de microarrays se limite à un certain nombre d’échantillons, le séquençage au moyen des techniques de nouvelle génération permet la caractérisation des interactions entre protéines et ADN de tout un génome en une seule fois.
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