Séquençage d’un métagénome complet
Avec Roche GS FLX+, Titanium
Votre projet métagénomique
Séquençage d’un métagénome complet
Stratégie
Séquençage avec le GS FLX+ de Roche
Echantillon possible
ADN
Séquençage
Avec le Roche GS FLX+ (protocole Titanium, lectures simples) et couverture de 15 à 20x
Bioinformatique
- Livraison des données brutes (format des données : fasta, qual, sff) ;
- Assemblage de novo (utilisation des outils en fonction du projet, format des données : ace) ;
- Clustering (tableau de répartition des clusters, graphique (format des données : fasta, xls, txt, png) ;
- Tableau de l’analyse BLAST (format des données : xls, txt) ;
- Statistiques bioinformatiques (répartition des contigs et couverture en format pdf ou xls).
Focus
Customer Service
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NEW! Sequencing Service featuring PacBio RS
Next Generation Sequencing Seminar
Next Gen Specialists on side
Genomics & Transcriptomes
Analyses & Visualisation
On the path to a deep understanding of the organism, two parameters are important to the interpretation of the Next Gen sequencing data: The use of various Next Gen systems to take advantage of each technology and the combination of different bioinformatic tools and their stepwise application.
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