
Nous réalisons des alignements de vos données de séquençage également après comparaison avec des séquences de référence connues. La découverte de polymorphismes et variations structurelles est alors fréquemment primordiale. Les résultats de l’alignement des projets de reséquençage sont fournis en divers formats de données, d’une part en format texte, mais également en format ace et gff pour une possible visualisation. Pour des analyses de variations plus poussées, nous utilisons des outils bioinformatiques exclusifs. Vous recevez les résultats de ces analyses en format texte ou xls.
| Méthode | Format des données |
|---|---|
| Alignement / Cartographie | fasta & qual et ace / gff |
| Analyse SNP | gff & xls |
| Tableau InDel | txt / xls |
(D) +49 (0) 7531 81 60 68
(F) +33 (0) 4 91 82 84 88
(GB) +44 (0) 207 691 4921
(S) +46 (0) 8 655 3609
Horaires d'ouverture:
8H00 - 18H00 CET (Lun-Vend)
Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)
Plus de logiciels pour le séquençage avec les technologies 454, Illumina et Sanger...