Clustering de données brutes (ADNc)

Représentation des gènes exprimés

 

Le groupement de séquences semblables en clusters permet de mieux représenter les gènes exprimés que cela ne serait possible avec la réalisation d’un assemblage. L’existence de structures primaires de protéines homologues, cas fréquent, peut dans certaines conditions suffire à entraîner de mauvais assemblages. L’utilisation d’un clustering minimise ce risque. On peut donc produire des profils d’expression plus judicieux et recueillir des informations plus fonctionnelles sur les protéines. Outre les données brutes en clusters, vous recevez des tableaux de cluster très détaillés, des tableaux de répartition cluster/tag, ainsi que des graphiques clairs.

Méthode Format des données
Clustering de données brutes (ADNc) fasta, qual
Tableau de cluster xls, ace
Tableau de répartition cluster / tag (UTR, régulomes) xls, txt
Graphique de répartition cluster / tag (UTR, régulomes) png

Comparison of transcriptome levels of different ESTs

 

 

 

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