Services bioinformatiques et logiciels

Solutions bioinformatiques sur mesure, adaptées à chaque projet : assemblage, cartographie, clustering, BLAST, annotation, visualisation

Le rôle de la bioinformatique est d’offrir des méthodes efficaces permettant d’interpréter les énormes quantités de données et les types de données hétérogènes générés par les techniques de nouvelle génération.

Le fait de connaître les outils et méthodes d’analyse disponibles permet non seulement d’économiser du temps et de l’argent, mais également de mener à bien un projet.

Notre équipe bioinformatique expérimentée développe des solutions et des routines bioinformatiques pouvant, selon la problématique personnelle, également être judicieusement couplées à des logiciels d’analyse existant déjà sur le marché, comme par ex.

• Roche GS De Novo Assembler (Newbler Assembler)
• MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly)
• Velvet (logiciel développé par EMBL-EBI, Cambridge, UK, pour l’assemblage de novo)
• Edena (Exact De Novo Assembler)
• ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases),
• Mosaik (de Michael Stromberg, Boston University),
• MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
• SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)