Tagging, Enrichment & Next Generation Sequencing

Deep Sequencing spezifischer Regionen einer großen Probenzahl

Ihr Anreicherungsprojekt

Sequenzierung angereicherter Proben jeglicher Größe und jeglicher Anzahl

Strategie

Anreicherung der Proben und anschließende Sequenzierung mit Illumina Genome Analyzer IIx | Single Reads zur SNP-Detektion

Ausgangsmaterial

genomische DNA

Tagging (optional)

• Library Präparation der genomischen DNA für Illumina Genom AnalyzerIIx

• Tagging um verschiedenartige Proben für die anschließende Sequenzierung zu mischen

Anreicherung

• Bait- /Oligo-Design für die Anreicherung mit dem Agilent Technologies SureSelect Target Enrichment System oder dem SureSelect DNA Capture Array
• Qualitätskontrolle der Baits
• Hybridisierung

Sequenzierung

• Illumina Genome Analyzer IIx : Single Reads zur SNP-Detektion
• Coverage mind. 30x in Abhängigkeit vom Projekt

Bioinformatik

• Mapping (Reads und gbk-Files)
• SNP-Analyse (Dateiformat txt / xls und BED)
• Bioinformatische Statistiken (Coverage-Verteilung)

• Single Reads
• Genome
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  • > Re-Sequenzierung
  • > Tagging, Enrichment & Next Generation Sequencing
• Transkriptome
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