
Wir führen Alignments Ihrer Sequenzierdaten auch gegen bekannte Referenzsequenzen durch. Dabei steht häufig die Aufdeckung von Polymorphismen und struktureller Variationen im Vordergrund. Die Ergebnisse des Alignments von sogenannten Resequenzierungsprojekten werden in unterschiedlichen Dateiformaten geliefert, einerseits in Textformat, aber auch für eine mögliche Visualiserung in ace und gff Format. Für weiterführende Variationsanalysen verwenden wir proprietäre bioinformatische Tools. Die Ergebnisse dieser Analysen erhalten Sie im txt- bzw. xls-Format.
| Methode | Datenformat |
|---|---|
| Alignment /Mapping | fasta & qual und ace / gff |
| SNP Analyse | gff & xls |
| InDel Tabelle | txt / xls |
(D) +49 (0) 7531 81 60 68
(F) +33 (0) 4 91 82 84 88
(GB) +44 (0) 207 691 4921
(S) +46 (0) 8 655 3609
DNASTAR (Sequenzanalyse, Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung)
Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)
Noch mehr Software für Next-Gen Sequenzierung...