
BLAST-Analysen (Basic Local Alignment Search Tool ) werden nach erfolgtem Clustering oder der de novo Assemblierung für einzelne Cluster bzw. Contigs durchgeführt. Das Ergebnis ist eine Auflistung all jener Sequenzen, die Ähnlichkeiten mit der Ausgangssequenz aufweisen. Wir verwenden unterschiedliche Datenbanken je nach Fragestellung, z.B. GenBank, GenPep oder auch kundenspezfische Datenbanken. Die BLAST-Analyse wird in Tabellenform im xls und txt Dateiformat geliefert.
(D) +49 - 7531 81 60 68
(F) +33 - 4 91 82 84 88
(GB) +44 - 207 691 4921
(S) +46 - 8 655 3609
Telefonisch erreichbar:
8-18 Uhr CET (Mo-Fr)
Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)
Noch mehr Software für Next-Gen Sequenzierung...