Maßgeschneiderte Bioinformatische Services

Ihr Projektziel diktiert die Wahl der Bioinformatik-Tools

 

Das Ziel eines Projekts mit bereits vorhandenen Sequenzdaten bestimmt nicht nur die Auswahl der Sequenziertechnologie oder Kombination zweier oder mehrerer Technologien, sondern sie diktiert auch den effizienten Einsatz bioinformatischer Lösungsansätze.

 

Es stellen sich viele Fragen, wie etwa: Welche verfügbaren Software-Tools können die Datenmengen verarbeiten und analysieren? Wie ist die Qualität der Analysen einzustufen? Ist es sinnvoll, Rohdaten für zukünftige Forschung zu speichern?

 

Wir helfen Ihnen bei der Beantwortung. Sie erhalten nicht nur die Rohdaten der Sequenzierung, detaillierte und übersichtliche Analysetabellen, Reports, Grafiken und bioinformatische Statistiken, sondern selbstverständlich eine individuelle, maßgeschneiderte Beratung und persönliche Unterstützung – auch nach Projektabschluß.

Technologie Datenformat
ABI 3730 xl abi
Roche GS FLX fasta, qual & sff
Illumina Genome Analyzer fasta, qual & scarf

Reduktion der Contigs durch Hybrid de novo Assemblierung

 

 

 

 

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Nützliche Links

 

DNASTAR (Sequenzanalyse, Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung)

Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)

 

Noch mehr Software für Next-Gen Sequenzierung...

 

 

 

 

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