
Das Ziel eines Projekts mit bereits vorhandenen Sequenzdaten bestimmt nicht nur die Auswahl der Sequenziertechnologie oder Kombination zweier oder mehrerer Technologien, sondern sie diktiert auch den effizienten Einsatz bioinformatischer Lösungsansätze.
Es stellen sich viele Fragen, wie etwa: Welche verfügbaren Software-Tools können die Datenmengen verarbeiten und analysieren? Wie ist die Qualität der Analysen einzustufen? Ist es sinnvoll, Rohdaten für zukünftige Forschung zu speichern?
Wir helfen Ihnen bei der Beantwortung. Sie erhalten nicht nur die Rohdaten der Sequenzierung, detaillierte und übersichtliche Analysetabellen, Reports, Grafiken und bioinformatische Statistiken, sondern selbstverständlich eine individuelle, maßgeschneiderte Beratung und persönliche Unterstützung – auch nach Projektabschluß.
| Technologie | Datenformat |
|---|---|
| ABI 3730 xl | abi |
| Roche GS FLX | fasta, qual & sff |
| Illumina Genome Analyzer | fasta, qual & scarf |
(D) +49 (0) 7531 81 60 68
(F) +33 (0) 4 91 82 84 88
(GB) +44 (0) 207 691 4921
(S) +46 (0) 8 655 3609
DNASTAR (Sequenzanalyse, Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung)
Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)
Noch mehr Software für Next-Gen Sequenzierung...