DNASTAR GenVision

Organisation und Visualisierung von Genomdaten

 

GenVision erstellt Abbildungen von großen Datenmengen zur bequemen Darstellung von Annotationen oder Vergleichen von verschiedenen Datentypen. GenVision wurde schon benutzt, um eine Reihe von annotierten Genomen zu veröffentlichen, und hat sich als ein sehr flexibles und leistungsfähiges Werkzeug für die Visualisierung bei großen oder komplexen Datensätzen bewährt.


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DNASTAR (Sequenzanalyse, Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung)

Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)

 

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