DNASTAR ArrayStar

Erweiterte Möglichkeiten bei der Genexpressionsanalyse, der Gencharakterisierung und bei RNA-Seq-Anwendungen

 

ArrayStar hat seinen Ruf als ein schnell zu lernendes Softwarepaket für die Genexpressionsanalyse etabliert, das viele leicht zu benutzende Visualisierungstools und analytische Werkzeuge anbietet.

 

ArrayStar v3.0 bietet mehrere NEUE Funktionalitäten, die den Prozess der Genexpression-Datenanalyse erleichtern und die Fähigkeiten von ArrayStar erweitern.

 

Zu diesen Funktionalitäten gehören:

  • Ein optionales Modul QSeq für RNA-Seq-Anwendungsanalysen 
  • Erweiterte Gencharakterisierungstabellen
  • Erweiterte Clustering-Grafiken
  • Zusätzliche Normalisierungsalgorithmen um die analysierbaren Datentypen zu erweitern
  • Netzwerkfähigkeit

 

RNA-Seq ist eine quantitative Methode zur Feststellung und Stärkemessung der mRNA-Expression. Solche Methoden erlauben den Vergleich der Expressionsstärke von verschiedenen Proben. RNA-Seq ermöglicht die Ausführung von Gen-Expressionsexperimenten durch die Benutzung von NextGen-Technologie. Das QSeq Modul von ArrayStar v3.0 erlaubt die leichte Quantifizierung von Genexpressionsstärken und hat einen großen Umfang an Visualisierungen.

 

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Nützliche Links

 

DNASTAR (Sequenzanalyse, Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung)

Roche GS De Novo Assembler (454 Life Science / Roche)
MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly, Bastien Chevreux)
Velvet (EMBL-EBI, Cambridge, UK)
Edena (Exact De Novo Assembler)
ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases)
Mosaik (Reference guided aligner/assembler)
MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)

 

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