Bioinformatische Services und Software

Maßgeschneiderte Bioinformatik-Lösungen: Assemblierung, Mapping, Clustering, BLAST, Annotation, Visualisierung

Aufgabe der Bioinformatik ist es, effiziente Methoden zur Auswertung der durch Next Generation Technologien generierten gigantischen Datenmengen und heterogenen Datentypen anzubieten.

Das Wissen um die zur Verfügung stehenden Analysetools und -methoden ist der entscheidende kosten- und zeitsparende Faktor für die erfolgreiche Durchführung eines Projekts.

Unser erfahrenes Bioinformatik-Team entwickelt bioinformatische Lösungen und Routinen, die je nach individueller Fragestellung auch mit bereits im Markt existierender Analysesoftware sinnvoll verknüpft werden, wie z.B. mit

• Roche GS De Novo Assembler (Newbler Assembler)
• MIRA (Mimicking Intelligent Read Assembly)
• Velvet (vom EMBL-EBI, Cambridge, UK, entwickelte Software zur de novo-Assemblierung)
• Edena (Exact De Novo Assembler)
• ELAND (Efficient Large-Scale Alignment of Nucleotide Databases),
• Mosaik (von Michael Stromberg, Boston University),
• MAQ (Mapping and Assembly with Qualities)
• SOAP (Short Oligonucleotide Alignment Program)